Команда заснована у 1960 році. Виступала під назвами «Авангард»(1960), «Десна» (1961—1970). З 1977 року знову «Десна». Срібний призер першості УСРСР серед команд другої ліги 1982 року. Півфіналіст Кубку України 1990 року. Срібний призер серед команд першої ліги в сезоні 2016/2017, бронзовий – 2017/2018.

Переможець групового турніру серед команд другої ліги в сезонах 1996/1997, 2005/2006 та 2012/2013. Срібний призер 2000/2001, та 2003/2004, 2004/2005. Бронзовий -2002/2003.

Кращий показник в Кубку України – вихід до ¼ фіналу в сезонах 2013/2014 та 2017/2018.

Досягнення гравців «Десни» в чемпіонатах України. Олександр Кожем’яченко – кращий бомбардир другої ліги в сезонах 2004/2005 (20 м’ячів) та 2005/2006 (21 м’яч), а також групових турнірів 2003/2004 (15 м’ячів) та 2010/2011 (12 м‘ячів).Юрій Яковенко – кращий бомбардир групового турніру в сезоні 2000/2001 (16 м’ячів).

Президент клубу – Володимир Левін.

Головний тренер – Олександр Рябоконь.

Вперше на майстрівському рівні футболісти з Чернігова з’явилися у 1960 році в класі «Б», де провели 9 сезонів (1960—1968).1968 рік став кращим в історії команди. У фінальному турнірі кращих команд класу «Б», який проходив В Тернополі, футболісти «Десни» лише за різницею м’ячів поступилися бронзовими нагородами кадїївському «Шахтарю». Але і 4 місце надало їм право виступати у 2 групі класу «А», де вони провели два сезони.

Чергова реорганізація чемпіонату СРСР (1971) позбавили чернігівців команди майстрів, але місто не залишилося без футболу. Компенсацією став виступ київського СКА на берегах Десни у 1971 році. Незабаром була створена команда СК «Чернігів» (теж армійська), яка захищала честь Чернігівщини з 1972 по1975 роки.

1976 рік теж був «чернігівським» для армійців Києва, а за наступного року знову почала виступати «Десна». Це право для неї завоював чернігівський «Хімік», який став чемпіоном України серед команд КФК 1976 року. Особливих успіхів у другій лізі наші гості не досягли. Винятком став 1982 рік, коли футболісти «Десни» стали срібними призерами чемпіонату.

Починаючи з 1992 року футболісти «Десни» виступають в незалежних чемпіонатах України.

Кращими для команди стали останні два сезони. У сезоні 2016/2017 «Десна» стала срібним призером чемпіонату серед команд першої ліги і завоювала право грати в УПЛ, але чомусь це право було надано рівненському «Вересу», котрий посів 3 сходинку в турнірній таблиці. Прикра несправедливість не зломила команду, і в минулому сезоні клуб досяг своєї мети. Блискуче провівши весняну частину чемпіонату і перемігши в матчах Плей-офф кропивницьку «Зірку», «Десна» завоювала собі місце серед еліти українського футболу.

Між собою футболісти «Десни» та «Олександрії» в Прем’єр Лізі провели 3 матчі: по 1 перемозі кожної з команд та одна нічия. Різниця м’ячів 4-3=+1 на користь чернігівців.

М’ячі в цих зустрічах забивали: Андрій Гітченко, Денис Фаворов, Орест Кузик, Олександр Філіппов (усі по 1 – «Десна»), Євген Банада , Валерій Бондаренко та Андрій Запорожан (усі по 1 – «Олександрія» ).

В складах обох команд грали майже 40 гравців. Найвідоміші з них: Вадим Постовой, Микола Федоренко, Олег Ратій, Юрій Паньків, Олександр Гребінюк, Віталій Гавриш, Андрій Смалько, Сергій Грибанов, Андрій Гітченко, Сергій Старенький, Євгеній Чепурненко, Михайло Козак, Руслан Зейналов, Вадим Кириллов, Вадим Воронченко, Володимир Дробот, Володимир Постолатьєв, Іван Богатир, Владислав Огиря, Денис Безбородько та Максим Умереков.

Юрій Грузнов кілька сезонів очолював «Десну», а також був одним із тренерів «Поліграфтехніки».

Фото: newch.tv